Ο παλαίμαχος ποδοσφαιριστής ξεκίνησε τα παρθενικά του βήματα στα γήπεδα του Πανιωνίου, ανέδειξε το ταλέντο του με τα «κιτρινόμαυρα», ενώ στη συνέχεια επέστρεψε στη Νέα Σμύρνη για να βάλει τελεία στο ταξίδι του.
Στις 14 Νοεμβρίου του 1993, ο Θωμάς Μαύρος, σημάδεψε το ελληνικό ποδόσφαιρο, αποχαιρέτησε την ενεργό δράση με μια φιλική αναμέτρηση μεταξύ της ΑΕΚ και της Εθνικής ομάδας.
Ο Θωμάς Μαύρος ξεκίνησε την ποδοσφαιρική του καριέρα από την Νέα Σμύρνη, αγωνίστηκε στην ομάδα στην ομάδα του Πανιωνίου όπου πραγματοποίησε 135 εμφανίσεις.
Έπειτα μεταγράφηκε στην ΑΕΚ όπου σε 277 αγώνες σκόραρε 174 γκολ!
Τέλος ολοκλήρωσε την καριέρα του στην ομάδα που τον ανέδειξε. Επιστρέφοντας στον Πανιώνιο πραγματοποίησε 89 εμφανίσεις σκοράροντας 51 γκολ.
Επίσης αποτελεί έναν από τους συνολικά δώδεκα ποδοσφαιριστές που έχουν σκοράρει 5 γκολ σε επίσημο αγώνα της Α΄ Εθνικής:
